Podem ser aplicados diversos tipos de cera, como parafina, cera de carnaúba ou cera de abelha. A parafina é de mais fácil obtenção e manuseio. Derrete em temperatura de aproximadamente 60ºC, o que facilita a sua aplicação. A plasticidade da parafina evita que os vasos fiquem quebradiços, aumentando a sua durabilidade.

A parafina é um material derivado do petróleo e não pode ser utilizada na impermeabilização do xaxim, quando o objetivo for gerar um produto que possa ser classificado como orgânico (com origem na agricultura orgânica). Nesse caso, pode ser usada a cera de carnaúba, que é um material renovável. Recomenda-se a cera de carnaúba Tipo 1, ou carnaúba Flor, que é uma cera de melhor qualidade, geralmente utilizada em marcenaria. A cera de carnaúba é mais difícil de se trabalhar, pois tem pouca plasticidade, derrete em temperatura de aproximadamente 95ºC, e solidifica rapidamente na temperatura ambiente. Os vasos obtidos com sua aplicação são mais quebradiços, com menor durabilidade.

Não há relatos sobre o uso de cera de abelha para produzir recipientes semelhantes ao xaxim agroecológico, mas esse produto pode ser uma alternativa adequada, pois apresenta características muito semelhantes às da parafina.

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